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沙棘苹果酸代谢关键基因ME的克隆与生物信息学分析

更新时间:2023-03-22
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沙棘苹果酸代谢关键基因ME的克隆与生物信息学分析


摘要 苹果酸酶(ME)参与苹果酸的降解,是植物苹果酸代谢的关键酶。本研究根据前期的沙棘转录组测序数据设计特异性引物,利用RT-PCR技术克隆ME基因(包括NAD-ME、NADP-ME)并进行生物信息学分析。结果表明,沙棘NAD-ME基因的完整开放阅读框长1 902 bp,编码一个由634个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α-螺旋(44.16%)、无规则卷曲(39.91%)和少量β-折叠(15.93%)构成,与枣的NAD-ME同源性最高。NADP-ME的完整开放阅读框长1 926 bp,编码一个由642个氨基酸组成的亲水性蛋白,主要由α-螺旋(37.07%)、无规则卷曲(45.64%)和少量β-折叠(15.29%)构成,与川桑和核桃NADP-ME的同源性较高。研究结果为探索沙棘苹果酸代谢的分子调控机制奠定理论基础。