中华绒螯蟹CYP4C基因的分子进化研究 摘 要 中华绒螯蟹(Eriocheir japonica sinensis)是一类重要的经济蟹类,可同时适应淡水和咸水的生活。然而,关于中华绒螯蟹渗透调节的分子机制一直不是特别清楚。本研究选取渗透调节中的关键基因CYP4C,在中华绒螯蟹和三疣梭子蟹两个物种中进行了对比分析。首先,从NCBI下载十个十足目动物的CYP4C基因的序列,进行系统发生关系的重构。接着,分别将中华绒螯蟹和三疣梭子蟹设置为前景枝,进行选择压力分析。最后,对中华绒螯蟹和三疣梭子蟹中CYP4C基因的表达量进行了检测。研究结果发现,中华绒螯蟹作为前景枝时,检测到了显著的正选择信号(ω2=25.51)。并且,相比于三疣梭子蟹,CYP4C在中华绒螯蟹中有更高的表达量。这些结果,提示中华绒螯蟹中CYP4C基因的功能得到了增强,以便于其更好的适应咸淡水的转换。 关键词:中华绒螯蟹;CYP4C基因;渗透调节;正选择 目 录 前 言 1 1 材料与方法 3 1.1 构建系统进化树 3 1.1.1 系统发生关系重建的目的 3 1.1.2 系统发生关系重建的方法 3 1.1.3 系统进化树的构建 3 1.2 压力分析 4 1.3 引物设计 4 1.4 qRT-PCR实验 5 1.4.1 实验的动物组织 5 1.4.2 实验试剂 6 1.4.3 实验仪器 6 1.4.4 提取RNA 6 1.4.5 合成cDNA并扩增 7 1.4.6 实时荧光定量PCR 8 2 结果 9 2.1 系统进化树 9 2.2 选择压力分析结果 12 2.3 实时荧光定量PCR结果 13 3 讨论 14 4 结论 15 参考文献 16 致 谢 18 |
中华绒螯蟹CYP4C基因的分子进化研究
更新时间:2019-12-04