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腺病毒7型感染肺炎患者病原学鉴定及六邻体基因特征分析

更新时间:2019-10-17
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腺病毒7型感染肺炎患者病原学鉴定及六邻体基因特征分析

摘要目的  对某单位首次发生的腺病毒7型肺炎患者进行病原学诊断,分析六邻体(Hexon)基因序列特征,探讨其流行变异趋势及变异规律。方法  采集患者咽拭样本,RT-PCR法进行病原体特异性片段检测;采用细胞A549培养和分离病毒;对Hexon基因进行测序并与GenBank 中其他腺病毒参考毒株序列进行比较; 采用Mega6.0软件Muscle法进行序列比对,最大似然法Tamura-Nei模型构建进化树并分析。结果  共分离获得腺病毒21株,均为B1亚组7型,该病毒六邻体基因序列长为2805bp,21株病毒均单独成簇,形成较为独立进化分支,21株分离株间同源性为99.9%~100%,与0901HZ_ShX_CHN_2009山西分离株,CHN_DG01_2011_7P7H7F7东莞分离株,CQ1198分离株等国内分离株同源性超过99.9%,与美国、阿根廷等国外分离株同源性也高达99.7%。所发现的792C-T、1818C-T和2739C-T三个位点突变均为沉默突变。其中792C-T和1818C-T为2000年以后腺病毒7型均存在的变异,2739C-T为此次特有的变异。结论  该单位分离获得的腺病毒7型毒株与国际和我国2000年后多数腺病毒7型流行株高度同源,变异风险较低。
关键词腺病毒7型;六邻体基因;分子特征